线粒体COⅢ 基因分析三种常见鲳鱼的亲缘关系
摘 要：金鲳(Trachinotus ovatus)、银鲳(Pampus argenteus)和中间低鳍鲳(Peprilus medius)是重要经济鱼种，其中后两种鱼外形较为相似，分类一直存在分歧．本研究随机采集烟台、青岛地区银鲳、中间低鳍鲳和金鲳的生鲜海鱼样本，提取3 种鱼的全基因组DNA，设计通用引物对目标基因进行PCR 扩增和测序，后对其线粒体COⅢ 全序列及ATP6部分序列进行基因多态性分析，探讨3 种鱼的亲缘关系；依据测序结果，设计各鱼种的特异引物，用特异引物和通用引物进行复合PCR 扩增方法对各鱼种进行种源性鉴定．通过比对分析测序结果，获得了中间低鳍鲳COⅢ 基因全序列及ATP6 基因部分序列且收录在NCBI 核苷酸数据库中，登录号分别为KT210112 和KT210113．证明NCBI GenBank中发布的刺鲳(Psenopsis anomala)序列(KP334103.1)实为中间低鳍鲳．遗传距离分析发现银鲳与金鲳的距离最大，与中间低鳍鲳次之，中间低鳍鲳与金鲳的遗传距离最小．采用复合PCR 方法，实现了在同一复合PCR 体系中有效区分3种鱼的方法，具有更加便捷、准确的优势．
论文下载：