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基于公共sRNAs 库的病毒检测分析研究

王亚静,王 珲,王 敏,徐 峰

摘    要:以公共的small RNAs (sRNAs)新一代测序数据为材料,通过生物信息学的分析方法检测生物实验系统样品中存在的病毒,讨论病毒与宿主间的关系,病毒的种属特性,进而指导生物实验设计.从GEO Datasets 数据库下载917个已发表的sRNAs 高通量测序数据,通过生物信息学分析共检测出来自334 个样品库的2107 条高度同源的病毒序列和2930 条疑似的病毒序列.这些病毒主要是正链RNA 病毒、反转录病毒和双链DNA 病毒,集中在花椰菜花叶病毒科、反转录病毒科、杆状病毒科和芜菁黄花叶病毒目.



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    津科备27-1号